8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_256661
Cell Name :  Fig2bi
Archive Name :  Szegedi_Paizs_Lamsa
Species Name :  mouse
Strain :  CB6-Tg(Gad1-EGFP)G42Zjh/J GAD67-GFP (line G42)
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  basket
Tertiary Cell Class :  GABAergic, Parvalbumin (PV)-positive
Original Format :  Neurolucida.nrx
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Biocytin, streptavidin-488
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-04-13
Date of Upload :  2023-04-03
Persistence Vector :  Fig2bi.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Robust perisomatic GABAergic self-innervation inhibits basket cells in the human and mouse supragranular neocortex.

Measurements
Soma Surface :  530.85 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  7
Number of Branches :  18
Overall Width :  47.36 μm
Overall Height :  66.18 μm
Overall Depth :  15.54 μm
Average Diameter :  0.32 μm
Total Length :  337.53 μm
Total Surface :  299.58 μm2
Total Volume :  35.68 μm3
Max Euclidean Distance :  54.78 μm
Max Path Distance :  79.44 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  324
Partition Asymmetry :  0.43
Average Rall's Ratio :  3.92
Average Bifurcation Angle Local :  95.65°
Average Bifurcation Angle Remote :  99.02°
Fractal Dimension :  1.07

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website