8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_283229
Cell Name :  Fig2A
Archive Name :  Song_WJ
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  21.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  temporal
Tertiary Brain Region :  layer 2
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-05-10
Date of Upload :  2024-06-11
Persistence Vector :  Fig2A.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Comparison of the Upper Marginal Neurons of Cortical Layer 2 with Layer 2/3 Pyramidal Neurons in Mouse Temporal Cortex.

Measurements
Soma Surface :  261.97 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  294
Number of Branches :  596
Overall Width :  202.71 μm
Overall Height :  240.39 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.41 μm
Total Length :  2350.74 μm
Total Surface :  3004.72 μm2
Total Volume :  369.06 μm3
Max Euclidean Distance :  182.82 μm
Max Path Distance :  219.45 μm
Max Branch Order :  51
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  2909
Partition Asymmetry :  0.84
Average Rall's Ratio :  1.94
Average Bifurcation Angle Local :  92.8°
Average Bifurcation Angle Remote :  86.89°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website