8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_66560
Cell Name :  FVB-1V1-LayerIII-6
Archive Name :  Murase
Species Name :  mouse
Strain :  FVB-NJ (wild type)
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-01-26
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  FVB-1V1-LayerIII-6.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Matrix Metalloproteinase-9 Regulates Neuronal Circuit Development and Excitability.

Measurements
Soma Surface :  1360.25 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  12
Number of Branches :  29
Overall Width :  227.04 μm
Overall Height :  499.67 μm
Overall Depth :  13.73 μm
Average Diameter :  0.96 μm
Total Length :  1916.38 μm
Total Surface :  6329.68 μm2
Total Volume :  2224.93 μm3
Max Euclidean Distance :  477.14 μm
Max Path Distance :  514.32 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  863
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  1.52
Average Bifurcation Angle Local :  88.35°
Average Bifurcation Angle Remote :  49.48°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website