8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_283365
Cell Name :  Exp230-Elsa-Section-1_1-Reconstruction-1
Archive Name :  H_Zhang
Species Name :  mouse
Strain :  Shank3 InsG3680+/+;B6.Cg-Tg(Thy1-YFP)HJrs/J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  association cortex, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Shank3 knockin
Staining Method :  yellow fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2024-06-17
Date of Upload :  2024-07-10
Persistence Vector :  Exp230-Elsa-Section-1_1-Reconstruction-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  SHANK3 Mutations Associated with Autism and Schizophrenia Lead to Shared and Distinct Changes in Dendritic Spine Dynamics in the Developing Mouse Brain.

Measurements
Soma Surface :  2299.8 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  36
Number of Branches :  78
Overall Width :  536.99 μm
Overall Height :  621.68 μm
Overall Depth :  97.77 μm
Average Diameter :  2.66 μm
Total Length :  7632.43 μm
Total Surface :  63081.7 μm2
Total Volume :  45412.6 μm3
Max Euclidean Distance :  495.27 μm
Max Path Distance :  644.18 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  1129
Partition Asymmetry :  0.44
Average Rall's Ratio :  1.55
Average Bifurcation Angle Local :  68.2°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.17°
Fractal Dimension :  1.02

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