8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_283401
Cell Name :  Exp230-Belle-Section-2_2-Reconstruction-1
Archive Name :  H_Zhang
Species Name :  mouse
Strain :  Shank3 InsG3680-/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  association cortex, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  yellow fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2024-06-17
Date of Upload :  2024-07-10
Persistence Vector :  Exp230-Belle-Section-2_2-Reconstruction-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  SHANK3 Mutations Associated with Autism and Schizophrenia Lead to Shared and Distinct Changes in Dendritic Spine Dynamics in the Developing Mouse Brain.

Measurements
Soma Surface :  5364.06 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  31
Number of Branches :  71
Overall Width :  469.67 μm
Overall Height :  567.68 μm
Overall Depth :  108.65 μm
Average Diameter :  2.82 μm
Total Length :  5037.49 μm
Total Surface :  45307.4 μm2
Total Volume :  40611.7 μm3
Max Euclidean Distance :  449.09 μm
Max Path Distance :  501.41 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  863
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  1.55
Average Bifurcation Angle Local :  66.44°
Average Bifurcation Angle Remote :  55.87°
Fractal Dimension :  1.02

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