8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_140233
Cell Name :  Evans_Ascencio_Khaliq_aldh1a1_120916_4rs
Archive Name :  Evans
Species Name :  mouse
Strain :  aldh1a1-cre/tdTomato
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  substantia nigra
Tertiary Brain Region :  pars compacta, ventral
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  dopaminergic
Tertiary Cell Class :  aldh1a1-positive
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Alexa Fluor 594
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2020-08-12
Date of Upload :  2020-09-29
Persistence Vector :  Evans_Ascencio_Khaliq_aldh1a1_120916_4rs.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Functional Dissection of Basal Ganglia Inhibitory Inputs onto Substantia Nigra Dopaminergic Neurons.

Measurements
Soma Surface :  993.45 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  29
Overall Width :  193.18 μm
Overall Height :  472.81 μm
Overall Depth :  93.97 μm
Average Diameter :  1.86 μm
Total Length :  1931.96 μm
Total Surface :  11696.4 μm2
Total Volume :  6357.9 μm3
Max Euclidean Distance :  314.19 μm
Max Path Distance :  402.9 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  585
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  2.03
Average Bifurcation Angle Local :  71.19°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.62°
Fractal Dimension :  1.02

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