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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_140221
Cell Name :  Evans_Ascencio_Khaliq_TH_042417_3rs
Archive Name :  Evans
Species Name :  mouse
Strain :  TH-eGFP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  substantia nigra
Tertiary Brain Region :  pars compacta
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  dopaminergic
Tertiary Cell Class :  tyrosine hydroxylase (TH) positive
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Alexa Fluor 594
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2020-08-12
Date of Upload :  2020-09-29
Persistence Vector :  Evans_Ascencio_Khaliq_TH_042417_3rs.pvec
Note :  AAV1-FLEX-hSyn-CoChR-GFP injected into dorsal striatum

Reference Article
Related Article Reference :  Functional Dissection of Basal Ganglia Inhibitory Inputs onto Substantia Nigra Dopaminergic Neurons.

Measurements
Soma Surface :  3020.33 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  24
Number of Branches :  50
Overall Width :  195.33 μm
Overall Height :  929.38 μm
Overall Depth :  68.79 μm
Average Diameter :  2 μm
Total Length :  4695.19 μm
Total Surface :  30211.7 μm2
Total Volume :  19046.1 μm3
Max Euclidean Distance :  528.35 μm
Max Path Distance :  693.77 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  1477
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  1.63
Average Bifurcation Angle Local :  69.71°
Average Bifurcation Angle Remote :  54.84°
Fractal Dimension :  1.03

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