8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_87640
Cell Name :  Ear_PosteriorMacula_R_07_32120
Archive Name :  Hildebrand
Species Name :  zebrafish
Strain :  Tg(elavl3:GCaMP5G)a4598 transgenic
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.5 days
Max Age :  5.5 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  ganglion
Secondary Brain Region :  right
Tertiary Brain Region :  posterior macula
Primary Cell Class :  sensory
Secondary Cell Class :  myelinated
Tertiary Cell Class :  Inner ear projecting
Original Format :  Catmaid.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium tetroxide/uranyl acetate
Slicing Direction :  perpendicular to the long axis
Slice Thickness :  0.06  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Catmaid
Date of Deposition :  2017-09-15
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  Ear_PosteriorMacula_R_07_32120.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Whole-brain serial-section electron microscopy in larval zebrafish.

Measurements
Soma Surface :  70.67 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  3
Number of Branches :  8
Overall Width :  19.37 μm
Overall Height :  95.5 μm
Overall Depth :  36.75 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  271.3 μm
Total Surface :  213.08 μm2
Total Volume :  13.32 μm3
Max Euclidean Distance :  82.39 μm
Max Path Distance :  112.09 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.66
Total Fragmentation :  1023
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  116.19°
Average Bifurcation Angle Remote :  42.09°
Fractal Dimension :  1.16

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website