8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07156
Cell Name :  EF062108-n4-5cell2
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  GIN
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  10.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Multiple
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 49% in z
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2010-07-29
Date of Upload :  2011-11-08
Persistence Vector :  EF062108-n4-5cell2.pvec
Note :  Secondary brain region- somatosensory, frontal or visual cortex
 

Reference Article
Related Article Reference :  Quantitative classification of somatostatin-positive neocortical interneurons identifies three interneuron subtypes.

Measurements
Soma Surface :  521.78 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  7
Number of Branches :  15
Overall Width :  201.9 μm
Overall Height :  163.35 μm
Overall Depth :  28.35 μm
Average Diameter :  0.28 μm
Total Length :  971.73 μm
Total Surface :  905.09 μm2
Total Volume :  169.31 μm3
Max Euclidean Distance :  223.69 μm
Max Path Distance :  289.88 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  2087
Partition Asymmetry :  0.64
Average Rall's Ratio :  1.26
Average Bifurcation Angle Local :  62.95°
Average Bifurcation Angle Remote :  62.42°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website