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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07253
Cell Name :  EC5-609202-2
Archive Name :  Buzsaki
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  not reported
Primary Brain Region :  entorhinal cortex
Secondary Brain Region :  layer 5
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.nrx
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 20%
Corrected 20%
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2010-11-18
Date of Upload :  2011-11-08
Persistence Vector :  EC5-609202-2.pvec
Note :  Additional reconstruction files of this cell available here.

Reference Article
Related Article Reference :  Intrinsic circuit organization and theta-gamma oscillation dynamics in the entorhinal cortex of the rat.

Measurements
Soma Surface :  821.29 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  1320
Number of Branches :  2649
Overall Width :  1448.49 μm
Overall Height :  1598.77 μm
Overall Depth :  1894.86 μm
Average Diameter :  0.26 μm
Total Length :  133336 μm
Total Surface :  111681 μm2
Total Volume :  9142 μm3
Max Euclidean Distance :  1873.05 μm
Max Path Distance :  5882.36 μm
Max Branch Order :  125
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  123245
Partition Asymmetry :  0.7
Average Rall's Ratio :  2.02
Average Bifurcation Angle Local :  116.67°
Average Bifurcation Angle Remote :  113.17°
Fractal Dimension :  1.03

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