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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07252
Cell Name :  EC3-80604
Archive Name :  Buzsaki
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  not reported
Primary Brain Region :  entorhinal cortex
Secondary Brain Region :  layer 3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.nrx
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 20%
Corrected 20%
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2010-11-18
Date of Upload :  2011-11-08
Persistence Vector :  EC3-80604.pvec
Note :  Additional reconstruction files of this cell available here.

Reference Article
Related Article Reference :  Intrinsic circuit organization and theta-gamma oscillation dynamics in the entorhinal cortex of the rat.

Measurements
Soma Surface :  974.53 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  215
Number of Branches :  439
Overall Width :  782.74 μm
Overall Height :  1221.53 μm
Overall Depth :  201.51 μm
Average Diameter :  0.47 μm
Total Length :  32329 μm
Total Surface :  47620.7 μm2
Total Volume :  6216.98 μm3
Max Euclidean Distance :  928.99 μm
Max Path Distance :  2492.14 μm
Max Branch Order :  35
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  22599
Partition Asymmetry :  0.62
Average Rall's Ratio :  2.12
Average Bifurcation Angle Local :  104.28°
Average Bifurcation Angle Remote :  95.86°
Fractal Dimension :  1.02

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