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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07249
Cell Name :  EC2-609291-4
Archive Name :  Buzsaki
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  not reported
Primary Brain Region :  entorhinal cortex
Secondary Brain Region :  layer 2
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.nrx
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 20%
Corrected 20%
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2010-11-18
Date of Upload :  2011-11-08
Persistence Vector :  EC2-609291-4.pvec
Note :  Additional reconstruction files of this cell available here.

Reference Article
Related Article Reference :  Intrinsic circuit organization and theta-gamma oscillation dynamics in the entorhinal cortex of the rat.

Measurements
Soma Surface :  1557.8 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  375
Number of Branches :  760
Overall Width :  1406.23 μm
Overall Height :  1973.55 μm
Overall Depth :  805.97 μm
Average Diameter :  0.29 μm
Total Length :  43281.8 μm
Total Surface :  46550.6 μm2
Total Volume :  4390.28 μm3
Max Euclidean Distance :  1785.37 μm
Max Path Distance :  3830.03 μm
Max Branch Order :  60
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  27439
Partition Asymmetry :  0.66
Average Rall's Ratio :  2.02
Average Bifurcation Angle Local :  118.43°
Average Bifurcation Angle Remote :  107.89°
Fractal Dimension :  1.02

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