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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_68267
Cell Name :  EB1-early-bifurcation
Archive Name :  Spruston
Species Name :  mouse
Strain :  Thy-1-EGFP line M
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.5 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Custom.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Custom
Date of Deposition :  2016-01-06
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  EB1-early-bifurcation.pvec
Note :  Generously provided by Aaron Millstein from Jeff Magee's group

Reference Article
Related Article Reference :  Structured Dendritic Inhibition Supports Branch-Selective Integration in CA1 Pyramidal Cells.

Measurements
Soma Surface :  59.43 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  66
Number of Branches :  136
Overall Width :  201.54 μm
Overall Height :  378.42 μm
Overall Depth :  102.99 μm
Average Diameter :  0.62 μm
Total Length :  6201.69 μm
Total Surface :  13411.7 μm2
Total Volume :  3038.46 μm3
Max Euclidean Distance :  335.43 μm
Max Path Distance :  423.94 μm
Max Branch Order :  19
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  10911
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  1.46
Average Bifurcation Angle Local :  85.32°
Average Bifurcation Angle Remote :  60.2°
Fractal Dimension :  1.03

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