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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_145880
Cell Name :  Dentate-Gyrus-4
Archive Name :  Chen_D
Species Name :  mouse
Strain :  Shank3 -/-: CAMKII alpha-Cre
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Calcium/calmodulin-dependent protein kinase II (CaMKII)-positive
Original Format :  Imaris.imx
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Shank3 knockout
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-11-16
Date of Upload :  2020-12-14
Persistence Vector :  Dentate-Gyrus-4.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A Whole-Brain Cell-Type-Specific Sparse Neuron Labeling Method and Its Application in a Shank3 Autistic Mouse Model.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  25
Number of Branches :  51
Overall Width :  100.01 μm
Overall Height :  184.15 μm
Overall Depth :  24.38 μm
Average Diameter :  0.93 μm
Total Length :  1382.95 μm
Total Surface :  4040.54 μm2
Total Volume :  939.42 μm3
Max Euclidean Distance :  203.98 μm
Max Path Distance :  218.2 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  4273
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  32.92°
Average Bifurcation Angle Remote :  41.46°
Fractal Dimension :  1.02

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