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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_145895
Cell Name :  Dentate-Gyrus-2-b
Archive Name :  Chen_D
Species Name :  mouse
Strain :  Shank3 +/+: CAMKII alpha-Cre
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Calcium/calmodulin-dependent protein kinase II (CaMKII)-positive
Original Format :  Imaris.imx
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-11-16
Date of Upload :  2020-12-14
Persistence Vector :  Dentate-Gyrus-2-b.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A Whole-Brain Cell-Type-Specific Sparse Neuron Labeling Method and Its Application in a Shank3 Autistic Mouse Model.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  405
Number of Branches :  812
Overall Width :  199.01 μm
Overall Height :  142.54 μm
Overall Depth :  27.56 μm
Average Diameter :  1.77 μm
Total Length :  2394.74 μm
Total Surface :  12542.4 μm2
Total Volume :  6000.89 μm3
Max Euclidean Distance :  147.86 μm
Max Path Distance :  237.86 μm
Max Branch Order :  82
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  5113
Partition Asymmetry :  0.79
Average Rall's Ratio :  1.65
Average Bifurcation Angle Local :  73.29°
Average Bifurcation Angle Remote :  85.43°
Fractal Dimension :  1.05

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