8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_00990
Cell Name :  DS1_270701
Archive Name :  Staiger
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  19.0 days
Max Age :  21.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Star
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2005-12-31
Date of Upload :  2006-09-02
Persistence Vector :  DS1_270701.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Functional diversity of layer IV spiny neurons in rat somatosensory cortex: quantitative morphology of electrophysiologically characterized and biocytin labeled cells.

Measurements
Soma Surface :  627.65 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  64
Number of Branches :  133
Overall Width :  778.73 μm
Overall Height :  988.86 μm
Overall Depth :  44.31 μm
Average Diameter :  0.33 μm
Total Length :  13807.1 μm
Total Surface :  12265.6 μm2
Total Volume :  1348.44 μm3
Max Euclidean Distance :  594.92 μm
Max Path Distance :  970.28 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  4880
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  1.8
Average Bifurcation Angle Local :  74.58°
Average Bifurcation Angle Remote :  58.06°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website