8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_110994
Cell Name :  DEFiNE-Processed_M010_mPFC
Archive Name :  Jensen
Species Name :  mouse
Strain :  En1::2ADre;Dbh::Flpo;RC::RFLTG
Structural Domains :  No Dendrites, No Soma, Axon
Physical Integrity :  Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  pons
Secondary Brain Region :  pontine tegmentum
Tertiary Brain Region :  Locus Coeruleus
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Noradrenergic
Tertiary Cell Class :  mPFC/A24-projecting
Original Format :  NeuronJ.ndf
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  NeuronJ
Date of Deposition :  2019-03-26
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  DEFiNE-Processed_M010_mPFC.pvec
Note :  AAV cre injected and processed with Digital Enhancement of Fibers with Noise (DEFiNE)

Reference Article
Related Article Reference :  DEFiNE: A Method for Enhancement and Quantification of Fluorescently Labeled Axons.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  37
Number of Branches :  75
Overall Width :  609.42 μm
Overall Height :  637.8 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  4911.49 μm
Total Surface :  15429.9 μm2
Total Volume :  3857.48 μm3
Max Euclidean Distance :  690.95 μm
Max Path Distance :  1461.1 μm
Max Branch Order :  17
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  744
Partition Asymmetry :  0.73
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  118.04°
Average Bifurcation Angle Remote :  108.37°
Fractal Dimension :  1.01

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