8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_09580
Cell Name :  DAN-01-R
Archive Name :  Henny
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  300 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  substantia nigra
Tertiary Brain Region :  pars compacta
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  dopaminergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Neurobiotin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Corrected 6% in xy, 8% in z
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2013-03-05
Date of Upload :  2013-05-06
Persistence Vector :  DAN-01-R.pvec
Note :  Neuron located on the right side of the brain.

Reference Article
Related Article Reference :  Structural correlates of heterogeneous in vivo activity of midbrain dopaminergic neurons.

Measurements
Soma Surface :  1039.6 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  341
Number of Branches :  689
Overall Width :  478.24 μm
Overall Height :  1136.43 μm
Overall Depth :  521.32 μm
Average Diameter :  0.78 μm
Total Length :  10080.6 μm
Total Surface :  25148.4 μm2
Total Volume :  6320.07 μm3
Max Euclidean Distance :  751.39 μm
Max Path Distance :  1072.64 μm
Max Branch Order :  97
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  4619
Partition Asymmetry :  0.85
Average Rall's Ratio :  1.31
Average Bifurcation Angle Local :  85.89°
Average Bifurcation Angle Remote :  86.4°
Fractal Dimension :  1.03

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