8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_165343
Cell Name :  Cux2_6_01_lh_1
Archive Name :  BICCN-MOp-miniatlas-anatomy
Species Name :  mouse
Strain :  Cux2-CreERT2; MORF3
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  50.0 days
Max Age :  50.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  18.7 grams
Max Weight :  18.7 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Aivia.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Aivia
Date of Deposition :  2020-04-03
Date of Upload :  2021-10-06
Persistence Vector :  Cux2_6_01_lh_1.pvec
Note :  This reconstruction was obtained from the Yang and Dong labs

Reference Article
Related Article Reference :  Cellular Anatomy of the Mouse Primary Motor Cortex

Measurements
Soma Surface :  36.45 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  17
Number of Branches :  38
Overall Width :  154.08 μm
Overall Height :  249.41 μm
Overall Depth :  150.39 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  2384 μm
Total Surface :  1872.39 μm2
Total Volume :  117.03 μm3
Max Euclidean Distance :  170.27 μm
Max Path Distance :  193.69 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  2434
Partition Asymmetry :  0.37
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  76.19°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.24°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website