8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_120157
Cell Name :  Ctx-SmoCKO-GFAP-astro7
Archive Name :  Garcia
Species Name :  mouse
Strain :  Gfap-Cre;Smofl/fl
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  90.0 days
Max Age :  90.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  Protoplasmic, GFAP-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Gfap Smo CKO
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-07-26
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  Ctx-SmoCKO-GFAP-astro7.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Sonic hedgehog signaling in astrocytes mediates cell type-specific synaptic organization

Measurements
Soma Surface :  110.4 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  36
Number of Branches :  80
Overall Width :  41.97 μm
Overall Height :  36.77 μm
Overall Depth :  10.62 μm
Average Diameter :  0.62 μm
Total Length :  562 μm
Total Surface :  1102.6 μm2
Total Volume :  173.44 μm3
Max Euclidean Distance :  30.51 μm
Max Path Distance :  41.28 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  318
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  1.91
Average Bifurcation Angle Local :  77.29°
Average Bifurcation Angle Remote :  66.29°
Fractal Dimension :  1.05

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