8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_120158
Cell Name :  Ctx-SmoCKO-GFAP-astro6
Archive Name :  Garcia
Species Name :  mouse
Strain :  Gfap-Cre;Smofl/fl
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  90.0 days
Max Age :  90.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  Protoplasmic, GFAP-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Gfap Smo CKO
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-07-26
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  Ctx-SmoCKO-GFAP-astro6.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Sonic hedgehog signaling in astrocytes mediates cell type-specific synaptic organization

Measurements
Soma Surface :  224.84 μm2
Number of Stems :  12
Number of Bifurcations :  34
Number of Branches :  80
Overall Width :  49.47 μm
Overall Height :  30.4 μm
Overall Depth :  17.6 μm
Average Diameter :  0.62 μm
Total Length :  633.36 μm
Total Surface :  1233.65 μm2
Total Volume :  191.22 μm3
Max Euclidean Distance :  31.08 μm
Max Path Distance :  42.5 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  287
Partition Asymmetry :  0.36
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  89.09°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.95°
Fractal Dimension :  1.04

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