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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_174836
Cell Name :  Cortex_780-1
Archive Name :  Lein
Species Name :  mouse
Strain :  T4826I-RYR1; CGG
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  27.0 days
Max Age :  31.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 4/5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-10-01
Date of Upload :  2022-01-14
Persistence Vector :  Cortex_780-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Sex and Genotype Modulate the Dendritic Effects of Developmental Exposure to a Human-Relevant Polychlorinated Biphenyls Mixture in the Juvenile Mouse.

Measurements
Soma Surface :  1166.83 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  25
Overall Width :  106.8 μm
Overall Height :  262.18 μm
Overall Depth :  9.69 μm
Average Diameter :  0.38 μm
Total Length :  944.19 μm
Total Surface :  1127.18 μm2
Total Volume :  107.08 μm3
Max Euclidean Distance :  146.18 μm
Max Path Distance :  146.88 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.98
Total Fragmentation :  85
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  53°
Average Bifurcation Angle Remote :  49.26°
Fractal Dimension :  1.01

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