8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_72100
Cell Name :  Cell_M
Archive Name :  Chen_SK
Species Name :  mouse
Strain :  BL/6; 129SvJ, Opn4CreERT2/+;Z/AP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  5.0 months
Gender :  Not reported
Min Weight :  20 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  ganglion layer
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  M1 type, Intrinsically photosensitive
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Opn4 expression
Staining Method :  alkaline phosphatase
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-04-07
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  Cell_M.pvec
Note :  Separate axonal and dendritic tracings are available here.

Reference Article
Related Article Reference :  Architecture of retinal projections to the central circadian pacemaker.

Measurements
Soma Surface :  5380.24 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  88
Number of Branches :  179
Overall Width :  3353.91 μm
Overall Height :  3701.05 μm
Overall Depth :  148.38 μm
Average Diameter :  0.26 μm
Total Length :  11134.1 μm
Total Surface :  9094.48 μm2
Total Volume :  591.14 μm3
Max Euclidean Distance :  4903.56 μm
Max Path Distance :  6151.98 μm
Max Branch Order :  33
Average Contraction :  0.68
Total Fragmentation :  5477
Partition Asymmetry :  0.68
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  95.55°
Average Bifurcation Angle Remote :  90.73°
Fractal Dimension :  1.12

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website