8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_106232
Cell Name :  Cell8_Subiculum_singlecell
Archive Name :  Williams
Species Name :  mouse
Strain :  Chrna2-Tom
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.5 months
Max Age :  1.8 months
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  subiculum
Secondary Brain Region :  Polymorphic layer
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Somatostatin (SOM)-positive
Tertiary Cell Class :  nicotinic acetylcholine receptor alpha2 (Chrna2)-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-10-22
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  Cell8_Subiculum_singlecell.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Electrophysiological and Morphological Characterization of Chrna2 Cells in the Subiculum and CA1 of the Hippocampus: An Optogenetic Investigation.

Measurements
Soma Surface :  1042.16 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  31
Number of Branches :  72
Overall Width :  524.74 μm
Overall Height :  272.45 μm
Overall Depth :  246.09 μm
Average Diameter :  0.26 μm
Total Length :  4453.15 μm
Total Surface :  3637.39 μm2
Total Volume :  236.43 μm3
Max Euclidean Distance :  546.27 μm
Max Path Distance :  763.45 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  489
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  82.58°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.47°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website