8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_106234
Cell Name :  Cell5_Hippocampus_singlecell
Archive Name :  Williams
Species Name :  mouse
Strain :  Chrna2-Tom
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.5 months
Max Age :  1.8 months
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal, stratum oriens
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  oriens-lacunosum moleculare
Tertiary Cell Class :  acetylcholine receptor alpha-2 (Chrna2)-positive, Somatostatin (SOM)-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-10-22
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  Cell5_Hippocampus_singlecell.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Electrophysiological and Morphological Characterization of Chrna2 Cells in the Subiculum and CA1 of the Hippocampus: An Optogenetic Investigation.

Measurements
Soma Surface :  563.72 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  19
Number of Branches :  47
Overall Width :  538.55 μm
Overall Height :  563.35 μm
Overall Depth :  68 μm
Average Diameter :  0.26 μm
Total Length :  4768.32 μm
Total Surface :  3894.83 μm2
Total Volume :  253.16 μm3
Max Euclidean Distance :  553.64 μm
Max Path Distance :  723.42 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  445
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  78.53°
Average Bifurcation Angle Remote :  51.24°
Fractal Dimension :  1.02

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