8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_106237
Cell Name :  Cell1_hippocampus_singlecell
Archive Name :  Williams
Species Name :  mouse
Strain :  Chrna2-Tom
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.5 months
Max Age :  1.8 months
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal, stratum oriens
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  oriens-lacunosum moleculare
Tertiary Cell Class :  acetylcholine receptor alpha-2 (Chrna2)-positive, Somatostatin (SOM)-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-10-22
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  Cell1_hippocampus_singlecell.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Electrophysiological and Morphological Characterization of Chrna2 Cells in the Subiculum and CA1 of the Hippocampus: An Optogenetic Investigation.

Measurements
Soma Surface :  676.76 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  38
Number of Branches :  85
Overall Width :  638.89 μm
Overall Height :  358.76 μm
Overall Depth :  74.52 μm
Average Diameter :  0.27 μm
Total Length :  5463.72 μm
Total Surface :  4634.49 μm2
Total Volume :  312.83 μm3
Max Euclidean Distance :  646.32 μm
Max Path Distance :  856.82 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  460
Partition Asymmetry :  0.6
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  81.3°
Average Bifurcation Angle Remote :  62.69°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website