8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_106154
Cell Name :  Cell-8_7
Archive Name :  Baltussen_Ultanir
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  16.0 days
Max Age :  57.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Cdkl5 knockout
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-10-17
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  Cell-8_7.pvec
Note :  4 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  Chemical genetic identification of CDKL5 substrates reveals its role in neuronal microtubule dynamics.

Measurements
Soma Surface :  164.92 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  29
Number of Branches :  66
Overall Width :  384.35 μm
Overall Height :  258.85 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.65 μm
Total Length :  1908.69 μm
Total Surface :  3897.61 μm2
Total Volume :  633.36 μm3
Max Euclidean Distance :  415.78 μm
Max Path Distance :  486.94 μm
Max Branch Order :  15
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  223
Partition Asymmetry :  0.62
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  91°
Average Bifurcation Angle Remote :  67.67°
Fractal Dimension :  1.03

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