8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_106221
Cell Name :  Cell-6_11
Archive Name :  Baltussen_Ultanir
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  16.0 days
Max Age :  57.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-10-17
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  Cell-6_11.pvec
Note :  4 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  Chemical genetic identification of CDKL5 substrates reveals its role in neuronal microtubule dynamics.

Measurements
Soma Surface :  181.09 μm2
Number of Stems :  12
Number of Bifurcations :  20
Number of Branches :  52
Overall Width :  259.82 μm
Overall Height :  342.87 μm
Overall Depth :  7.51 μm
Average Diameter :  0.64 μm
Total Length :  1638.28 μm
Total Surface :  3307.67 μm2
Total Volume :  534.44 μm3
Max Euclidean Distance :  315.18 μm
Max Path Distance :  454.17 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  191
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  88.75°
Average Bifurcation Angle Remote :  91.38°
Fractal Dimension :  1.03

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