8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_106194
Cell Name :  Cell-5_13
Archive Name :  Baltussen_Ultanir
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  16.0 days
Max Age :  57.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-10-17
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  Cell-5_13.pvec
Note :  4 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  Chemical genetic identification of CDKL5 substrates reveals its role in neuronal microtubule dynamics.

Measurements
Soma Surface :  203.08 μm2
Number of Stems :  11
Number of Bifurcations :  30
Number of Branches :  71
Overall Width :  204.75 μm
Overall Height :  491.41 μm
Overall Depth :  0.6 μm
Average Diameter :  0.63 μm
Total Length :  2255.29 μm
Total Surface :  4435.82 μm2
Total Volume :  707.09 μm3
Max Euclidean Distance :  297.72 μm
Max Path Distance :  443.69 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  337
Partition Asymmetry :  0.59
Average Rall's Ratio :  2.04
Average Bifurcation Angle Local :  84°
Average Bifurcation Angle Remote :  77.47°
Fractal Dimension :  1.02

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