8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_111992
Cell Name :  Cell-20111125SC1
Archive Name :  Topolnik
Species Name :  mouse
Strain :  Vip-eGFP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  15.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  15 grams
Max Weight :  20 grams
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  oriens/alveus border
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  GABAergic
Tertiary Cell Class :  Vasoactive Intestinal Peptide (VIP)-positive, subiculum-projecting
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-04-17
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  Cell-20111125SC1.pvec
Note :  Soma surface should be used for quantitative analysis

Reference Article
Related Article Reference :  Connectivity and network state-dependent recruitment of long-range VIP-GABAergic neurons in the mouse hippocampus.

Measurements
Soma Surface :  53.07 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  330
Number of Branches :  662
Overall Width :  852.99 μm
Overall Height :  1177.3 μm
Overall Depth :  71 μm
Average Diameter :  0.86 μm
Total Length :  24252 μm
Total Surface :  61031.5 μm2
Total Volume :  16009 μm3
Max Euclidean Distance :  1223.71 μm
Max Path Distance :  1833.95 μm
Max Branch Order :  40
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  14502
Partition Asymmetry :  0.65
Average Rall's Ratio :  1.53
Average Bifurcation Angle Local :  91.02°
Average Bifurcation Angle Remote :  81.36°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website