8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_106014
Cell Name :  Cell-2-2_7
Archive Name :  Baltussen_Ultanir
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  16.0 days
Max Age :  57.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Ctip2-negative
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Cdkl5 knockout
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-10-17
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  Cell-2-2_7.pvec
Note :  11 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  Chemical genetic identification of CDKL5 substrates reveals its role in neuronal microtubule dynamics.

Measurements
Soma Surface :  651.35 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  51
Number of Branches :  112
Overall Width :  160.21 μm
Overall Height :  250.41 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.32 μm
Total Length :  2574.14 μm
Total Surface :  2620.16 μm2
Total Volume :  212.23 μm3
Max Euclidean Distance :  177.96 μm
Max Path Distance :  196.35 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.97
Total Fragmentation :  318
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  74.53°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.09°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website