8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_106023
Cell Name :  Cell-17_5
Archive Name :  Baltussen_Ultanir
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  16.0 days
Max Age :  57.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Ctip2-negative
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Cdkl5 knockout
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-10-17
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  Cell-17_5.pvec
Note :  11 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  Chemical genetic identification of CDKL5 substrates reveals its role in neuronal microtubule dynamics.

Measurements
Soma Surface :  449.04 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  22
Number of Branches :  49
Overall Width :  123.28 μm
Overall Height :  222.17 μm
Overall Depth :  0.95 μm
Average Diameter :  0.32 μm
Total Length :  1042.96 μm
Total Surface :  1061.6 μm2
Total Volume :  85.99 μm3
Max Euclidean Distance :  163.6 μm
Max Path Distance :  169.55 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.98
Total Fragmentation :  113
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  57.61°
Average Bifurcation Angle Remote :  52.15°
Fractal Dimension :  1.01

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