8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_106209
Cell Name :  Cell-13_7
Archive Name :  Baltussen_Ultanir
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  16.0 days
Max Age :  57.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-10-17
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  Cell-13_7.pvec
Note :  4 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  Chemical genetic identification of CDKL5 substrates reveals its role in neuronal microtubule dynamics.

Measurements
Soma Surface :  196.83 μm2
Number of Stems :  11
Number of Bifurcations :  18
Number of Branches :  47
Overall Width :  237.98 μm
Overall Height :  776.08 μm
Overall Depth :  4.78 μm
Average Diameter :  0.64 μm
Total Length :  2532.72 μm
Total Surface :  5123.73 μm2
Total Volume :  828.7 μm3
Max Euclidean Distance :  589.96 μm
Max Path Distance :  724.64 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  246
Partition Asymmetry :  0.65
Average Rall's Ratio :  1.96
Average Bifurcation Angle Local :  79.83°
Average Bifurcation Angle Remote :  51.37°
Fractal Dimension :  1.02

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