8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_106003
Cell Name :  Cell-13-5
Archive Name :  Baltussen_Ultanir
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  16.0 days
Max Age :  57.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-10-17
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  Cell-13-5.pvec
Note :  11 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  Chemical genetic identification of CDKL5 substrates reveals its role in neuronal microtubule dynamics.

Measurements
Soma Surface :  369.16 μm2
Number of Stems :  12
Number of Bifurcations :  38
Number of Branches :  88
Overall Width :  163.65 μm
Overall Height :  366.59 μm
Overall Depth :  2.17 μm
Average Diameter :  0.32 μm
Total Length :  2436.7 μm
Total Surface :  2480.26 μm2
Total Volume :  200.9 μm3
Max Euclidean Distance :  333.96 μm
Max Path Distance :  390.92 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.97
Total Fragmentation :  257
Partition Asymmetry :  0.65
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  72.8°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.73°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website