8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_106191
Cell Name :  Cell-10-4_1
Archive Name :  Baltussen_Ultanir
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  16.0 days
Max Age :  57.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-10-17
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  Cell-10-4_1.pvec
Note :  4 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  Chemical genetic identification of CDKL5 substrates reveals its role in neuronal microtubule dynamics.

Measurements
Soma Surface :  280.29 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  49
Number of Branches :  106
Overall Width :  546.61 μm
Overall Height :  631.5 μm
Overall Depth :  13.89 μm
Average Diameter :  0.65 μm
Total Length :  3899.97 μm
Total Surface :  7963.88 μm2
Total Volume :  1294.13 μm3
Max Euclidean Distance :  522.13 μm
Max Path Distance :  750.27 μm
Max Branch Order :  15
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  457
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  63.44°
Average Bifurcation Angle Remote :  50.35°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website