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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_116541
Cell Name :  C_GFP_0003_final
Archive Name :  Firestein
Species Name :  rat
Strain :  Not reported
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  18.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  NeuronJ.swc
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  NeuronJ
Date of Deposition :  2018-12-02
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  C_GFP_0003_final.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Overexpression of cypin alters dendrite morphology, single neuron activity, and network properties via distinct mechanisms.

Measurements
Soma Surface :  57.82 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  35
Number of Branches :  80
Overall Width :  27.99 μm
Overall Height :  46.61 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.3 μm
Total Length :  402.4 μm
Total Surface :  379.25 μm2
Total Volume :  28.44 μm3
Max Euclidean Distance :  29.91 μm
Max Path Distance :  34.58 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  737
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  63.32°
Average Bifurcation Angle Remote :  52.06°
Fractal Dimension :  1.02

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