8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_162445
Cell Name :  CXG1423_1b
Archive Name :  Piirainen
Species Name :  mouse
Strain :  CX3CR1(G/G)-GFP
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  56.0 days
Max Age :  84.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  left
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  30  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2021-07-23
Date of Upload :  2021-09-15
Persistence Vector :  CXG1423_1b.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Microglia contribute to social behavioral adaptation to chronic stress.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  32
Number of Branches :  65
Overall Width :  16.5 μm
Overall Height :  48.5 μm
Overall Depth :  38.13 μm
Average Diameter :  0.54 μm
Total Length :  431.05 μm
Total Surface :  738.39 μm2
Total Volume :  118.74 μm3
Max Euclidean Distance :  38.85 μm
Max Path Distance :  51.98 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  2119
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  1.97
Average Bifurcation Angle Local :  40.34°
Average Bifurcation Angle Remote :  59.97°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website