8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_116672
Cell Name :  CUS4-CA3-3-20X-2
Archive Name :  Franklin
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer, dorsal
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Chronic Unpredictable Stress
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  25  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-02-17
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  CUS4-CA3-3-20X-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Persistent Increase in Microglial RAGE Contributes to Chronic Stress-Induced Priming of Depressive-like Behavior.

Measurements
Soma Surface :  147.65 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  85
Number of Branches :  175
Overall Width :  32.64 μm
Overall Height :  69.8 μm
Overall Depth :  50.08 μm
Average Diameter :  0.8 μm
Total Length :  1075.66 μm
Total Surface :  2703.44 μm2
Total Volume :  540.69 μm3
Max Euclidean Distance :  55.43 μm
Max Path Distance :  114.25 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  292
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  104.53°
Average Bifurcation Angle Remote :  97.95°
Fractal Dimension :  1.14

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website