8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78879
Cell Name :  CULTURE-6_1
Archive Name :  Papageorgiou_Kann
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  8.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  LPS-triggered
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-18
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  CULTURE-6_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  TLR4-activated microglia require IFN-gamma to induce severe neuronal dysfunction and death in situ.

Measurements
Soma Surface :  253.66 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  7
Number of Branches :  23
Overall Width :  37.16 μm
Overall Height :  27.86 μm
Overall Depth :  3.46 μm
Average Diameter :  1.06 μm
Total Length :  198.47 μm
Total Surface :  649.57 μm2
Total Volume :  182.33 μm3
Max Euclidean Distance :  31.01 μm
Max Path Distance :  34.76 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  94
Partition Asymmetry :  0.36
Average Rall's Ratio :  1.39
Average Bifurcation Angle Local :  83.76°
Average Bifurcation Angle Remote :  70.55°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website