8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78876
Cell Name :  CULTURE-4_2
Archive Name :  Papageorgiou_Kann
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  8.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  LPS-triggered
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-18
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  CULTURE-4_2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  TLR4-activated microglia require IFN-gamma to induce severe neuronal dysfunction and death in situ.

Measurements
Soma Surface :  1273.22 μm2
Number of Stems :  11
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  29
Overall Width :  51.23 μm
Overall Height :  27.08 μm
Overall Depth :  9.01 μm
Average Diameter :  1.11 μm
Total Length :  332.93 μm
Total Surface :  1131.99 μm2
Total Volume :  319.97 μm3
Max Euclidean Distance :  31.88 μm
Max Path Distance :  39.22 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  130
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  1.6
Average Bifurcation Angle Local :  104.03°
Average Bifurcation Angle Remote :  81.2°
Fractal Dimension :  1.08

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website