8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_114483
Cell Name :  CTR-2-Slice-2-Cell-1
Archive Name :  Beckstead
Species Name :  mouse
Strain :  DAT+/+ x TfamloxP/loxP
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.8 months
Max Age :  7.8 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  substantia nigra
Tertiary Brain Region :  pars compacta, medial
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  dopaminergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Neurobiotin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2019-04-15
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  CTR-2-Slice-2-Cell-1.pvec
Note :  Secondary antibody for staining was 'Streptavidin-DyLight 488'

Reference Article
Related Article Reference :  Progressively disrupted somatodendritic morphology in dopamine neurons in a mouse Parkinson's model.

Measurements
Soma Surface :  3576.07 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  22
Overall Width :  375.26 μm
Overall Height :  245.11 μm
Overall Depth :  27.98 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  1897.98 μm
Total Surface :  1490.67 μm2
Total Volume :  93.17 μm3
Max Euclidean Distance :  241.3 μm
Max Path Distance :  295.21 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  3499
Partition Asymmetry :  0.37
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  21.57°
Average Bifurcation Angle Remote :  53.01°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website