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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_114497
Cell Name :  CTR-14-Slice-3-Cell-1
Archive Name :  Beckstead
Species Name :  mouse
Strain :  DAT+/+ x TfamloxP/loxP
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.8 months
Max Age :  7.8 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  substantia nigra
Tertiary Brain Region :  pars compacta, lateral
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  dopaminergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Neurobiotin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2019-04-15
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  CTR-14-Slice-3-Cell-1.pvec
Note :  Secondary antibody for staining was 'Streptavidin-DyLight 488'

Reference Article
Related Article Reference :  Progressively disrupted somatodendritic morphology in dopamine neurons in a mouse Parkinson's model.

Measurements
Soma Surface :  2683.95 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  8
Number of Branches :  21
Overall Width :  409.2 μm
Overall Height :  208.9 μm
Overall Depth :  23.97 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  1882.48 μm
Total Surface :  1478.49 μm2
Total Volume :  92.41 μm3
Max Euclidean Distance :  281.64 μm
Max Path Distance :  336.18 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  3509
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  20.16°
Average Bifurcation Angle Remote :  66.43°
Fractal Dimension :  1.04

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