8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_49349
Cell Name :  CS56_pyramidal_cell
Archive Name :  Kondo
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  21.0 days
Max Age :  21.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  32 grams
Max Weight :  32 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  secondary motor, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 90%
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-07-13
Date of Upload :  2016-09-01
Persistence Vector :  CS56_pyramidal_cell.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Functional effects of distinct innervation styles of pyramidal cells by fast spiking cortical interneurons.

Measurements
Soma Surface :  1256.4 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  149
Number of Branches :  304
Overall Width :  601.82 μm
Overall Height :  1081.27 μm
Overall Depth :  215.28 μm
Average Diameter :  0.63 μm
Total Length :  20458.2 μm
Total Surface :  41828.6 μm2
Total Volume :  9332.24 μm3
Max Euclidean Distance :  637.49 μm
Max Path Distance :  962.44 μm
Max Branch Order :  17
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  10391
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  2.02
Average Bifurcation Angle Local :  83.31°
Average Bifurcation Angle Remote :  79.65°
Fractal Dimension :  1.04

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