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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_168236
Cell Name :  CIN-Er81-KO1
Archive Name :  Dehorter
Species Name :  mouse
Strain :  Er81 fl/fl;Nkx2.1-creER;GFP
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  30.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  cholinergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.hoc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Er81 Knockout
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  60  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2021-10-17
Date of Upload :  2021-11-18
Persistence Vector :  CIN-Er81-KO1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Er81 Transcription Factor Fine-Tunes Striatal Cholinergic Interneuron Activity and Drives Habit Formation.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  8
Number of Branches :  18
Overall Width :  71.89 μm
Overall Height :  220.09 μm
Overall Depth :  15.19 μm
Average Diameter :  1.8 μm
Total Length :  486.11 μm
Total Surface :  2887 μm2
Total Volume :  3317.85 μm3
Max Euclidean Distance :  133.75 μm
Max Path Distance :  150.93 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  782
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  10.29
Average Bifurcation Angle Local :  38.82°
Average Bifurcation Angle Remote :  76.34°
Fractal Dimension :  1.01

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