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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_194249
Cell Name :  CH155-6E_CA_HC_S2L_CA1_3-g
Archive Name :  Gareau
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  42.0 days
Max Age :  56.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) treated
Staining Method :  Alexa Fluor 546
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2022-06-18
Date of Upload :  2022-08-10
Persistence Vector :  CH155-6E_CA_HC_S2L_CA1_3-g.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Neonatal Enteropathogenic Escherichia coli Infection Disrupts Microbiota-Gut-Brain Axis Signaling.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  153
Number of Branches :  308
Overall Width :  24.02 μm
Overall Height :  68.79 μm
Overall Depth :  33.71 μm
Average Diameter :  0.85 μm
Total Length :  1294.19 μm
Total Surface :  3448.58 μm2
Total Volume :  813.37 μm3
Max Euclidean Distance :  42.57 μm
Max Path Distance :  64.36 μm
Max Branch Order :  21
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  8384
Partition Asymmetry :  0.63
Average Rall's Ratio :  2.04
Average Bifurcation Angle Local :  41.69°
Average Bifurcation Angle Remote :  66°
Fractal Dimension :  1.05

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