8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_194317
Cell Name :  CH153-3LB_CA_HC_S2R_CA1-b
Archive Name :  Gareau
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  42.0 days
Max Age :  56.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Alexa Fluor 546
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2022-06-18
Date of Upload :  2022-08-10
Persistence Vector :  CH153-3LB_CA_HC_S2R_CA1-b.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Neonatal Enteropathogenic Escherichia coli Infection Disrupts Microbiota-Gut-Brain Axis Signaling.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  68
Number of Branches :  138
Overall Width :  19.19 μm
Overall Height :  28.64 μm
Overall Depth :  34.64 μm
Average Diameter :  0.75 μm
Total Length :  455.57 μm
Total Surface :  1080.5 μm2
Total Volume :  220.59 μm3
Max Euclidean Distance :  26.31 μm
Max Path Distance :  54.83 μm
Max Branch Order :  18
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  2839
Partition Asymmetry :  0.65
Average Rall's Ratio :  2.03
Average Bifurcation Angle Local :  46.7°
Average Bifurcation Angle Remote :  78.15°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website