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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_233419
Cell Name :  CB_Adulthood_Control_F_Animal05_Trace041
Archive Name :  Siegert
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  2.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  cerebellum
Secondary Brain Region :  cerebellar cortex
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2021-02-11
Date of Upload :  2022-09-22
Persistence Vector :  CB_Adulthood_Control_F_Animal05_Trace041.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Microglial MorphOMICs unravel region- and sex-dependent morphological phenotypes from postnatal development to degeneration

Measurements
Soma Surface :  38.62 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  21
Overall Width :  22.24 μm
Overall Height :  70.93 μm
Overall Depth :  42.8 μm
Average Diameter :  1.78 μm
Total Length :  243.27 μm
Total Surface :  1382.1 μm2
Total Volume :  673.38 μm3
Max Euclidean Distance :  40.45 μm
Max Path Distance :  62.89 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  978
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  2.09
Average Bifurcation Angle Local :  38.35°
Average Bifurcation Angle Remote :  89.4°
Fractal Dimension :  1.03

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