8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78700
Cell Name :  CA3cell-1
Archive Name :  Papageorgiou_Kann
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Pilocarpine-induced epilepsy
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  30  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-18
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  CA3cell-1.pvec
Note :  Glutamine synthetase staining

Reference Article
Related Article Reference :  Redistribution of astrocytic glutamine synthetase in the hippocampus of chronic epileptic rats.

Measurements
Soma Surface :  158.94 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  16
Number of Branches :  35
Overall Width :  35.2 μm
Overall Height :  21.49 μm
Overall Depth :  6.96 μm
Average Diameter :  0.39 μm
Total Length :  198.66 μm
Total Surface :  296.41 μm2
Total Volume :  65.19 μm3
Max Euclidean Distance :  22.99 μm
Max Path Distance :  30.3 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  327
Partition Asymmetry :  0.4
Average Rall's Ratio :  1.08
Average Bifurcation Angle Local :  74.24°
Average Bifurcation Angle Remote :  76.29°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website