8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78186
Cell Name :  CA1_13
Archive Name :  Papageorgiou_Kann
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  29.0 days
Max Age :  31.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  115 grams
Max Weight :  130 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  450  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-18
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  CA1_13.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Widespread activation of microglial cells in the hippocampus of chronic epileptic rats correlates only partially with neurodegeneration.

Measurements
Soma Surface :  207.41 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  25
Number of Branches :  58
Overall Width :  56.09 μm
Overall Height :  51.16 μm
Overall Depth :  4.14 μm
Average Diameter :  0.8 μm
Total Length :  579.19 μm
Total Surface :  1448.6 μm2
Total Volume :  301.91 μm3
Max Euclidean Distance :  38.88 μm
Max Path Distance :  60.32 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  339
Partition Asymmetry :  0.39
Average Rall's Ratio :  1.8
Average Bifurcation Angle Local :  96.11°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.24°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website