8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_97366
Cell Name :  CA1-dendrites-20X-9_z00_ch00_1
Archive Name :  Zhou
Species Name :  mouse
Strain :  Thy1-GFP-M
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  60.0 days
Max Age :  60.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  glutamatergic
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2018-04-11
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  CA1-dendrites-20X-9_z00_ch00_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Loss of CDKL5 in Glutamatergic Neurons Disrupts Hippocampal Microcircuitry and Leads to Memory Impairment in Mice.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  46
Number of Branches :  94
Overall Width :  225.91 μm
Overall Height :  570.9 μm
Overall Depth :  20.2 μm
Average Diameter :  1.8 μm
Total Length :  4268.72 μm
Total Surface :  24152.9 μm2
Total Volume :  10941.2 μm3
Max Euclidean Distance :  456.37 μm
Max Path Distance :  489.15 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  7880
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  1.99
Average Bifurcation Angle Local :  68.73°
Average Bifurcation Angle Remote :  46.88°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website